Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms