Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms