Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CTDSP2O14595 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CTDSP2O14595 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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