Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-1B6SEH8 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms