Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms