Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF316A6NFI3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms