Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms