Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKP3Q9Y446 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms