Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms