Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POMPQ9Y244 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms