Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms