Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms