Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAK1Q9UPV9 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms