Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF8Q9UPP1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms