Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC12A4Q9UP95 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms