Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED23Q9ULK4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED23Q9ULK4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED23Q9ULK4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED23Q9ULK4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED23Q9ULK4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED23Q9ULK4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED23Q9ULK4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED23Q9ULK4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED23Q9ULK4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED23Q9ULK4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED23Q9ULK4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED23Q9ULK4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED23Q9ULK4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED23Q9ULK4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED23Q9ULK4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED23Q9ULK4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
MED23Q9ULK4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED23Q9ULK4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED23Q9ULK4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED23Q9ULK4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms