Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms