Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms