Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms