Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms