Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms