Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms