Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms