Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms