Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms