Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms