Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms