Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR4Q9NPB9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR4Q9NPB9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR4Q9NPB9 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR4Q9NPB9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR4Q9NPB9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR4Q9NPB9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms