Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCC2Q9HCC0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCC2Q9HCC0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCC2Q9HCC0 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCC2Q9HCC0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCC2Q9HCC0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCC2Q9HCC0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCC2Q9HCC0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCC2Q9HCC0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms