Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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