Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE41Q9C0J9 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms