Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms