Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms