Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC2Q9C0B9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC2Q9C0B9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC2Q9C0B9 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC2Q9C0B9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC2Q9C0B9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC2Q9C0B9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC2Q9C0B9 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC2Q9C0B9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC2Q9C0B9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC2Q9C0B9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC2Q9C0B9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC2Q9C0B9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC2Q9C0B9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC2Q9C0B9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC2Q9C0B9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC2Q9C0B9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC2Q9C0B9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC2Q9C0B9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC2Q9C0B9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC2Q9C0B9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC2Q9C0B9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC2Q9C0B9 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC2Q9C0B9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC2Q9C0B9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC2Q9C0B9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC2Q9C0B9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZCCHC2Q9C0B9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC2Q9C0B9 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms