Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms