Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms