Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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