Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms