Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms