Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms