Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms