Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms