Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms