Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms