Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB12

SMYD1, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD1, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD1Q8NB12 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMYD1Q8NB12 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms