Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms