Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP13Q86W25 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms