Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRCQ7RTU9 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms