Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms