Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWH4

FAM198B, Protein FAM198B, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM198BQ6UWH4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM198BQ6UWH4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms